Depuis le 15 septembre, l’Inserm met à la disposition de ses équipes de recherche la plateforme, accessibles en toute autonomie, de services génériques HDS et non-HDS pour le stockage et le traitement des données, le calcul haute performance ou la recherche clinique, présentée aux responsables d’unités lors de la Journée de l’Inserm 2026.
Entre-temps, ces services ont été testés par des chercheuses et des chercheurs ambassadeurs dont les retours ont permis d’affiner l’offre de l’Institut pour correspondre au mieux aux besoins des équipes. Les ambassadeurs ont salué la fluidité du parcours utilisateur. Le transfert des données ne nécessite plus de recourir à un VPN. Le nombre de partitions de calcul est passé d’une dizaine à 50. De nouvelles librairies ont été ajoutées pour le calcul HPC.
Ces services sont gratuits dans un premier temps, pour les rendre accessibles au plus grand nombre. Puis ils deviendront payants afin de garantir leur pérennité.
Trois offres complémentaires
L’Inserm propose trois offres complémentaires non exclusives : une même équipe peut activer plusieurs offres selon ses besoins.
Conception, test et calcul HPC (HDS uniquement – offre 2)
L’offre 2 repose sur une infrastructure de calcul mutualisée haute puissance sur GPU ou CPU (50 partitions). Elle permet la conception, le test et l’exploitation des calculs dans un cadre HDS.
La plateforme met à disposition une suite d’outils pré‑packagés pour les utilisateurs les moins matures, notamment : BioContainer, Jupyterlab, RStudio, Code-server et des librairies sécurisées. Les calculs peuvent aussi être exécutés en ligne de commande directement depuis une bulle sécurisée.
La plateforme permet de travailler sans rupture, grâce à l’exécution de pipelines de traitement conteneurisés déjà existants avec Apptainer et grâce à la possibilité d’importer ses propres données.
CPU ou GPU
Les CPU sont adaptés aux calculs scientifiques classiques, souvent utilisés pour des calculs génomiques. Tandis que les GPU sont particulièrement performants pour les traitements intensifs et parallèles, comme l’apprentissage automatique, le deep learning ou le traitement d’images et de vidéos.
Infrastructure (HDS et non-HDS – offre 3)
L’offre 3 fournit un socle d’infrastructure générique en environnement HDS ou non-HDS selon les cas. Elle est composée de :
- machines virtuelles sécurisées allant jusqu’à 16 CPU et 64 Go de RAM,
- espaces de stockage, incluant du stockage objet de type S3.
La combinaison RAM/CPU des machines virtuelles est modulable et peut être modifiée librement par les chercheurs pour s’adapter au mieux à leurs besoins.
À venir. Outillage pour la recherche clinique (HDS et non-HDS – offre 1)
L’offre 1 est un ensemble d’outils dédiés à la recherche clinique qui couvre les principales étapes du cycle de vie de la donnée : collecte avec REDCap, gestion et exploitation avec l’entrepôt de données de santé Greenplum. Cette offre prévoit un accompagnement pour la configuration et la prise en main de la solution. Cette offre sera disponible à l’automne 2026.
Des outils transverses
Un pack d’outil commun permet, notamment : la mise en qualité la donnée (par exemple Apache Airflow), le transfert des données massives sécurisé, l’accès à des repositories même en environnement HDS, l’accélération de l’ingénierie logicielle
Facile d’accès, la plateforme Cloud self-service de l’Inserm ne requiert pas de VPN, même pour le transfert des données.
Accompagnement
- Des guides d’utilisation pas à pas sont disponibles sur le portail des services numériques (section Se documenter).
- Les équipes support sont joignables sur services.inserm.fr et par téléphone.
- Des séances de questions-réponses seront organisées en septembre et en octobre.