En septembre prochain, l’Inserm décidera de mettre ou non à la disposition de ses équipes la solution collaborative de traitement des données de recherche Adlin-Workspace proposée à l’essai depuis le mois de février. Avant d’arrêter son choix, l’Institut souhaite obtenir d’autres retours d’expérience et les avis des personnes intéressées. Un questionnaire sera transmis dans la semaine du 8 au 12 juillet pour collecter les retours des chercheuses et des chercheurs.
Essayez Adlin Workplace
Demandez à essayer la solution en contactant : support-enc.dsi@inserm.fr.
Découvrez la solution lors d’un séminaire de présentation
Celles et ceux qui n’auraient pas le temps pour des essais peuvent découvrir la solution lors de séminaires de présentation en ligne. Pour cela, Adlin Science et l’Inserm vous invitent à vous connecter à ces rendez-vous.
- Lundi 17 Juin à 11h. Présentation de l’outil Esquisse pour explorer vos données avec des outils de visualisation disponible sous R sans avoir besoin de coder.
Se connecter - Lundi 24 Juin à 11h. Présentation d’un référentiel de structuration des données cliniques et omiques utilisé en oncologie qui sera prochainement intégré dans Adlin : le référentiel Osiris.
Se connecter - Lundi 1er Juillet à 11h. Utilisation de Renv pour le stockage des paquets pour permettre de travailler de manière interopérable.
Se connecter - Jeudi 4 Juillet à 11h. Un retour d’expérience d’une chercheuse Inserm qui nous présentera l’utilisation de la Workspace Adlin dans ses travaux de recherche.
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Adlin Workplace en bref
Adlin-Workspace, développé par la société Adlin Science, est un outil collaboratif de gestion et de traitement de données. Il s’adresse aux biologistes, aux techniciens, aux bio-informaticiens, aux data scientists, comme aux chefs d’équipe et aux équipes de direction.
Destiné à faciliter la conduite de projets de recherche, cet outil propose une interface optimisée pour la définition de protocoles et pour l’importation, l’exportation et la manipulation des données.
Le logiciel donne notamment accès à des outils de bioinformatique intégrés pour éditer et lancer des scripts en se connectant à la puissance de calcul. Il propose un environnement de code commun et permet de présenter ses résultats sous forme graphique et de générer des rapports. Le workspace permet la constitution de datasets et de base de données FAIR-by-Design. Il est particulièrement adapté à l’exploration des données omiques.
Si les retours d’utilisateurs s’avèrent positifs et que l’Inserm décide l’adoption d’Adlin-Workspace, cette solution aura vocation à être installée sur le Cloud HDS (hébergement des données de santé) de l’Institut.
