Les contenus de la région '' vous seront proposés par défaut, en plus des contenus nationaux sur tout le site. Ce choix s'appliquera également lors de vos prochaines visites.
COL-INTER-REG - NGS sur Minlon : prise en main et exploitation des donnees du 06 au 10 Juin 2026
Domaine : TS 1 BM - Genome - Trans.
Sous-domaine : Biologie Moleculaire, Genome, Transcrip.
Entité organisatrice : DR Paris IDF Centre Nord
Délégation régionale : DR Paris IDF Centre Nord
Région : Ile-de-France
Date limite d'inscription : 26/05/26
Public
Public : Toute personne travaillant sur le systeme MinlON Nanopore
Métiers :
Pré-requis : Maitriser les bases de la biologie moleculaire
Contenu de la formation
Objectif : Apprehender l'utilisation de l'equipement et savoir mettre en place une strategie de sequencage adaptee a l'analyse recherchee (type d'echantillons, thematique, resultats recherches, etc.) ; Design de banques d'ADN et/ou d'ARN ; Savoir exploiter l'interface ; Apprehender l'utilisation des logiciels de traitement des sequences et savoir faire le parallele avec d'autres logiciels et workflow (EPI2ME Agent; EPI2ME Labs; Galaxy).
Programme : ENSEIGNEMENTS THEORIQUES Principe du sequencage : du design des nanopores, des canaux, des puits et de la flow cell ; Presentation des differents kits de sequencage ; Work-flow de plateforme de sequencage : Preparation des echantillons - Chargement de la puce Mise en route du sequencage Suivi du sequencage -Telechargement des donnees. Principe de preparation d'une banque d'ADN ou Nettoyage et conservation de la flow-cell ; Suivi du controle qualite du sequencage (QC - Qscore) ; Explication de l'ensemble de l'interface TRAVAUX PRATIQUES Preparation d'une librairie a partir de plusieurs echantillons - Utilisation d'un kit (a determiner en fonction de l’echantillon) : Controle qualite de la flow- cell ; Design du ; controle de Qualite ; Chargement de la puce ; Mise en place et Suivi du sequencage via l'interface ; Exploitation des donnees generees avec les logiciels EPI2ME Agent ; EPI2ME Labs et d'autres workflow de Galaxy;.
Modalités pédagogiques : Theorie et exercices pratiques
Intervenant(s) : Christian SIATKA et Stephane SAUVAGERE, Ecole de l'ADN de Nimes
Sessions proposées
| Début | Fin | Durée en jours | Durée en heures | Limite d'inscription | Lieu | Information complémentaire |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 09/06/26 | 10/06/26 | 2 | 14 | 26/05/26 | ROSNY-SOUS-BOIS |
Contact
Nom : BRAHAMI
Prénom : Kamelia
Fonction : Assistante Formation
Téléphone :
Mail : xnzryvn.oenunzv@vafrez.se
Adresse : 86-88 rue Regnault
Ville : Paris
Code postal : 75013